Les mâles sont de très bons chanteurs : ils peuvent gazouiller de puissantes mélodies, ce qui peut surprendre au vu de leur petite taille.
Le troglodyte fréquente différents habitats. Il apprécie généralement les forêts humides de feuillus. Il y occupe les strates basses. C’est une espèce généraliste avec une grande capacité d’adaptation, il est donc retrouvé dans de nombreux milieux à l’instar des bocages, des marais, des ripisylves (la végétation située le long des cours d’eau), des parcs publics et des jardins. Il est même présent en ville.
Le troglodyte mignon est un oiseau sémillant et discret. Toujours en mouvement, il passe une grande partie de son temps au sol ou a proximité. Très fouineur, il aime les zones de feuillage denses comme le lierre. A la recherche de nourriture, il arpente les tas de feuilles, de branchages, de compost et les massifs denses dans les jardins potagers. Le troglodyte ne s'éloigne guère de cachettes éventuelles afin de pouvoir échapper rapidement à d'éventuels prédateurs. En effet, les courtes ailes du passereau ne lui permette de réaliser qu'un vol bas sur de faibles distances.
Le troglodyte a un régime essentiellement insectivore. Il se nourrit également d’araignées et quand l’occasion s’y porte à des alevins de poissons ou de petits têtards.
Chaque début de printemps, les troglodytes mâles partent à la recherche de mousses, de feuilles mortes et de brindilles afin de construire un nid pour les femelles. Ce dernier est fréquemment installé le long des façades couvertes de lierre ou de vigne vierge. Les troglodytes sont polygames, les mâles construisent plusieurs nids. C'est la femelle qui choisit où elle niche et par conséquent son partenaire.
La période de reproduction s'étale d'avril à juin. Après accouplement, elle déposera entre 5 à 8 minuscules œufs blancs maculés de taches rouges. L'éclosion a lieu une quinzaine de jours après la ponte. Le mâle et la femelle nourrissent les oisillons pendant un gros mois avant que ceux ci ne quittent le nid à la recherche d'un nouveau territoire. En conditions favorables, il peut y avoir deux nichées par an.
Le troglodyte est sédentaire. Il ne va pas occuper les mangeoires en hiver.