La formation des couples a lieu en hiver, du mois de janvier au mois de mars. Dès que le couple est formé, le mâle se met en évidence au sommet d'une branche et chante bruyamment, afin d'être bien repéré de ses congénères. Tout intrus s'approchant du territoire du jeune couple sera immédiatement chassé par le mâle.
Le rouge gorge est une espèce semi-cavernicole qui construit son nid près du sol, dans une anfractuosité de rocher ou d'arbre. Celui-ci est toujours bien caché dans la végétation. Au mois de mars-avril, la femelle construit seule le nid avec de la mousse, des brindilles et des feuilles sèches. L'ensemble est ensuite recouvert de crins, poils et autres herbes desséchées. Durant la construction, le mâle cherche de la nourriture pour la femelle.
La femelle dépose ensuite dans le nid 5 à 7 œufs, jaunes pâles, tachetés de brun clair. Seule la femelle couve les œufs. L'éclosion aura lieu 13 jours plus tard. Deux semaines après, les jeunes quittent le nid mais ils ne sont pas pour autant déjà indépendants. Les parents continuent en effet de les nourrir et de les éduquer durant les 3 semaines qui suivent.
Un couple de rouge gorge effectue 1 à 2 couvées par an.